Тридцатидевятилетний иеромонах Мисаил, постриженник Николо-Берлюковской пустыни, принявший руководство Екатерининской пустынью в 1842 году, был вторым из ее наиболее выдающихся строителей и обновителей. При нем монастырская ризница пополнилась богатой утварью: иконами, сосудами, дорогими священническими облачениями. Настоятель иеромонах Мисаил вызолотил главы и кресты на соборном храме и колокольне, построил два корпуса братских келий у западной стены монастыря, две гостиницы, одну деревянную, другую по первому этажу каменную, соорудил почти все хозяйственные постройки, в перестроенном виде дошедшие до наших дней.